Исследование ассоциации однонуклеотидных полиморфизмов rs7164665, rs71461059, rs74765750, rs6762529 с внезапной сердечной смертью

Цель. Подтверждение ассоциации с внезапной сердечной смертью (ВСС) однонуклеотидных полиморфизмов rs7164665, rs71461059, rs74765750, rs6762529, выявленных в собственном полногеномном ассоциативном исследовании в качестве новых молекулярно-генетических маркеров ВСС.

Материал и методы. Дизайн исследования “случай-контроль”. Группа ВСС сформирована с использованием критериев ВСС Европейского общества кардиологов (n=438, средний возраст — 53,2±9,1 лет, доля мужчин — 72,7%, женщин — 28,3%). Контрольная группа (n=435, средний возраст 53,2±8,9 года, мужчины — 70,0%, женщины — 30,0%) подобрана по полу и возрасту к группе ВСС из банка ДНК международных проектов MONICA и HAPIEE. ДНК выделена методом фенол-хлороформной экстракции из ткани миокарда в группе ВСС и венозной крови в контрольной группе. Генотипирование выполнено методом полимеразной цепной реакции с последующим анализом полиморфизма длин рестрикционных фрагментов. Полученные результаты статистически обработаны с помощью пакета программ SPSS 16.0.

Результаты. В группе ВСС и контрольной группе не найдено носителей редкого аллеля А однонуклеотидного полиморфизма rs74765750. Не выявлено статистически значимых различий между группой ВСС и контрольной группой по частотам генотипов и аллелей однонуклеотидных полиморфизмов rs7164665 и rs71461059. В возрастной группе старше 50 лет доля носителей гетерозиготного генотипа СТ однонуклеотидного полиморфизма rs6762529 в группе ВСС статистически значимо меньше по сравнению с контрольной группой (CT vs CC+TT: ОШ=0,686, 95% ДИ 0,483-0,967 р=0,035).

Заключение. Генотип СТ однонуклеотидного полиморфизма rs6762529 ассоциирован с протективным эффектом в отношении ВСС для лиц старше 50 лет. Не подтверждена ассоциация с ВСС однонуклеотидных полиморфизмов rs7164665, rs71461059, rs74765750.

1. Priori SG, Blomstrom-Lundqvist C, Mazzanti A, et al. The Task Force for the Management of Patients with Ventricular Arrhythmias and the Prevention of Sudden Cardiac Death of the European Society of Cardiology (ESC). G Ital Cardiol. 2016; 17(2): 108-70. doi:10.1714/2174.23496.

2. Бабенко В. Н., Максимов В. Н., Кулакова Е. В., Сафронова НАУЧНЫЙ СОТРУДНИК, Воевода М. И., Рогаев Е. И. Полногеномный анализ пулированных выборок ДНК когорт человека. Вавиловский журнал генетики и селекции. 2014;18(4-2):847-55.

3. Huyghe JR, Jackson AU, Fogarty MP, et al. Exome array analysis identifies new loci and low-frequency variants influencing insulin processing and secretion. Nat Genet. 2013;45(2):197-201. doi:10.1038/ng.2507.

4. rs74765750. dbSNP. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/SNP/snp_ref.cgi?do_not_redirect&rs=rs74765750 (26 May 2019).

5. rs7164665. dbSNP. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/SNP/snp_ref.cgi?do_not_redirect&rs=rs7164665(26 May 2019).

6. rs71461059. dbSNP. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/SNP/snp_ref.cgi?do_not_redirect&rs=rs71461059(26 May 2019).

7. rs6762529.dbSNP. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/SNP/snp_ref.cgi7do_not_redirect&rs=rs6762529(26 May 2019).

8. Tonkin ET, Smith M, Eichhorn P, et al. A giant novel gene undergoing extensive alternative splicing is severed by a Cornelia de Lange-associated translocation breakpoint at 3q26.3. Hum Genet. 2004;115(2):139-48.

9. Kim SW, Jung YS, Ahn JB, et al. Identification of genetic susceptibility loci for intestinal Behcet's disease. Sci Rep. 2017;7:39850. doi:10.1038/srep39850.

10. Burgner D, Davila S, Breunis WB, et al. A genome-wide association study identifies novel and functionally related susceptibility Loci for Kawasaki disease. PLoS Genet. 2009;5(1):e1000319. doi:10.1371/journal.pgen.1000319.

11. Ayerza Casas A, Puisac Uriol B, Teresa Rodrigo ME, et al. Cornelia de Lange syndrome: Congenital heart disease in 149 patients. Med Clin (Barc). 2017; 149(7):300-2. doi:10.1016/j.medcli.2017.03.051.

12. Kim JJ, Yun SW, Yu JJ, et al. Identification of SAMD9L as a susceptibility locus for intravenous immunoglobulin resistance in Kawasaki disease by genome-wide association analysis. Pharmacogenomics J. 2019. doi:10.1038/s41397-019-0085-1

13. Jin HJ, Jung S, DebRoy AR, et al. Identification and validation of regulatory SNPs that modulate transcription factor chromatin binding and gene expression in prostate cancer. Oncotarget. 2016;7(34):54616-26. doi:10.18632/oncotarget.10520.

14. Berndt SI, Wang Z, Yeager M, Alavanja MC, et al. Two susceptibility loci identified for prostate cancer aggressiveness. Nat Commun. 2015;6:6889. doi:10.1038/ncomms7889.

15. Kuo PH, Chuang LC, Su MH, et al. Genome-Wide Association Study for Autism Spectrum Disorder in Taiwanese Han Population. PLoS One. 2015;10(9):e0138695. doi:10.1371/journal.pone.0138695.

16. Koczkowska M, Wierzba J, Smigiel R, et al. Genomic findings in patients with clinical suspicion of 22q11.2 deletion syndrome. J Appl Genet. 2017;58(1):93-8. doi: 10.1007/s13353-016-0366-1.