russjcardiolРоссийский кардиологический журналRussian Journal of Cardiology1560-40712618-7620«SILICEA-POLIGRAF» LLC10.15829/1560-4071-2018-10-64-69russjcardiol-2915Research ArticleОРИГИНАЛЬНЫЕ СТАТЬИORIGINAL ARTICLESОднонуклеотидные варианты rs6582147, rs10010305, rs2136810, rs17797829 как новые молекулярно-генетические маркеры внезапной сердечной смертиSingle nucleotide variants rs6582147, rs10010305, rs2136810, rs17797829 as new molecular genetic markers of sudden cardiac deathhttps://orcid.org/0000-0002-9460-6294ИвановаА. А.IvanovaA. A.

Иванова Анастасия Андреевна       — кандидат медицинских наук, младший научный сотрудник лаборатории молекулярно-генетических терапевтических заболеваний.

 

ivanova_a_a@mail.ruhttps://orcid.org/0000-0002-7165-4496МаксимовВ. Н.MaksimovV. N.

Максимов Владимир Николаевич — доктор медицинских наук, профессор, заведующий лабораторией молекулярно-генетических исследований терапевтических заболеваний ИЦиГ СО РАН; профессор кафедры медицинской генетики и биологии медико-профилактического факультета НГМУ.

medik11@mail.ruhttps://orcid.org/0000-0002-9814-2159МоисееваД. И.MoiseevaD. I.dnadiagnosis@mail.ruhttps://orcid.org/0000-0001-6539-0466МалютинаС. К.MalyutinaS. K.

Малютина Софья Константиновна — доктор медицинских наук , профессор, профессор кафедры терапии, гематологии и трансфузиологии факультета повышения квалификации и профессиональной переподготовки врачей НГМУ, заведующая лабораторией этиопатогенеза и клиники внутренних заболеваний ИЦиГ СО РАН.

smalyutina@hotmail.comhttps://orcid.org/0000-0002-6312-5543НовоселовВ. П.NovoselovV. P.

Новоселов Владимир Павлович— доктор медицинских наук, профессор, начальник.

nokbsme@nso.ruhttps://orcid.org/0000-0001-9425-413XВоеводаМ. И.VoevodaM. I.

Воевода Михаил Иванович— доктор медицинских наук, профессор, академик РАН, директор ИЦиГ СО РАН.

mvoevoda@yandex.ruНИИ терапии и профилактической медицины - филиал ФГБНУ Федеральный исследовательский центр Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наукРоссияSRI of Therapy and Prevention Medicine — branch of FSBSI Federal Research Center Institute of Cytology and Genetics of SD RASRussian FederationНИИ терапии и профилактической медицины — филиал ФГБНУ Федеральный исследовательский центр Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук; Новосибирский государственный медицинский университет Минздрава РоссииРоссияSRI of Therapy and Prevention Medicine — branch of FSBSI Federal Research Center Institute of Cytology and Genetics of SD RAS; Novosibirsk State Medical UniversityRussian FederationНовосибирский государственный медицинский университет Минздрава РоссииРоссияNovosibirsk State Medical UniversityRussian FederationНовосибирское областное клиническое бюро судебно-медицинской экспертизыРоссияNovosibirsk Oblast Clinical Bureau of Forensic ExpertiseRussian FederationНИИ терапии и профилактической медицины — филиал ФГБНУ Федеральный исследовательский центр Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наукРоссияSRI of Therapy and Prevention Medicine — branch of FSBSI Federal Research Center Institute of Cytology and Genetics of SD RASRussian Federation2018060920180106469Copyright © Иванова А.А., Максимов В.Н., Моисеева Д.И., Малютина С.К., Новоселов В.П., Воевода М.И., 20182018Иванова А.А., Максимов В.Н., Моисеева Д.И., Малютина С.К., Новоселов В.П., Воевода М.И.Ivanova A.A., Maksimov V.N., Moiseeva D.I., Malyutina S.K., Novoselov V.P., Voevoda M.I.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://russjcardiol.elpub.ru/jour/article/view/2915Цель

Цель. Подтверждение ассоциации с внезапной сердечной смертью (ВСС) однонуклеотидных полиморфизмов rs6582147, rs 10010305, rs2136810, rs17797829, выявленных как наиболее вероятные кандидатные маркеры в собственном полногеномном ассоциативном исследовании.

Материал и методы

Материал и методы. Группа ВСС (n=360, средний возраст 53,0±9,2 лет, мужчины — 76,9%, женщины — 23,1%) сформирована с использованием критериев ВСС Европейского общества кардиологов. Контрольная группа (n=402, средний возраст 52,9±9,1 лет, мужчины — 69,7%, женщины — 30,3%) подобрана по полу и возрасту из банка ДНК международных иссле­дований MONICA, HAPIEE. ДНК выделена методом фенол-хлороформной экстракции. Генотипирование выполнено методом полимеразной цепной реакции с последующим анализом полиморфизма длин рестрикционных фрагментов.

Результаты

Результаты. Генотип GT rs6582147 ассоциирован с протективным эффектом в отношении ВСС (ОШ =0,671, 95% ДИ 0,496-0,909, р=0,011), а генотип GG — с повышенным риском ВСС (ОШ =1,598, 95% ДИ 1,195-2,135, р=0,002), с наи­большим развитием эффекта в группе мужчин старше 50 лет (р<0,05). Генотип СТ полиморфизма rs10010305 ассоциирован с ВСС в группе мужчин (ОШ =1,773, 95% ДИ 1,085-2,897, р=0,027), в группе мужчин старше 50 лет (р<0,05) и в группе лиц старше 50 лет без разделения по полу (ОШ =1,719, 95% ДИ 1,038-2,847 р=0,041). Генотип GG rs2136810 ассоциирован с повышенным риском ВСС (ОШ =1,372, 95% ДИ 1,005-1,871, р=0,049), в группе лиц старше 50 лет генотип GA rs2136810 ассоциирован с протективным эффектом в отноше­нии ВСС (ОШ =0,642, 95% ДИ 0,422-0,976, р=0,045). В группе женщин генотип GG rs17797829 является протективным в отношении ВСС (ОШ =0,392, 95% ДИ 0,203-0,760, р=0,007), в группе женщин старше 50 лет кроме генотипа GG с ВСС ассоциирован генотип АА этого же полиморфизма (ОШ =2,739, 95% ДИ 2,176-3,448, р=0,020).

Заключение

Заключение. Однонуклеотидные полиморфизмы rs6582147 rs10010305, rs2136810, rs17797829, выявленные в собственном полногеномном ассоциа­тивном исследовании, подтвердили ассоциацию с ВСС по результатам реплицирующего исследования.

Aim

Aim. To confirm association between sudden cardiac death (SCD) and single nucleotide polymorphisms rs6582147 rs 10010305, rs2136810, rs17797829, identified as the most likely candidate markers.

Material and methods

Material and methods. The SCD group (n=360, mean age 53,0±9,2 years, men — 76,9%, women — 23,1%) was formed using the SCD criteria of the European Society of Cardiology. The control group (n=402, mean age 52,9±9,1 years, men — 69,7%, women — 30,3%) was selected by gender and age from the DNA bank of international studies MONICA, HAPIEE. DNA is separated by phenol-chloroform extraction. Genotyping was performed by polymerase chain reaction followed by analysis of restriction fragment length polymorphism.

Results

Results. The GT rs6582147 genotype is associated with a protective effect on SCD (OR=0,671, 95% CI 0,496-0,909, p=0,011), and the GG genotype with an increased risk of SCD (OR=1,598, 95% CI 1,195-2,135, p=0,002). The greatest effect was in the group of men over 50 years old (p<0,05). The CT rs10010305 genotype is associated with SCD in the group of men (OR=1,773, 95% CI 1,085-2,897 p=0,027), in the group of men over 50 years old (p<0,05) and in the group of people over 50 years old without separation according to sex (OR=1,719, 95% CI 1,038-2,847 p=0,041). The GG rs2136810 genotype is associated with an increased risk of SCD (OR=1,372, 95% CI 1,005-1,871, p=0,049); in the group of people over 50, the GA rs2136810 genotype is associated with a protective effect against SCD (OR=0,642, 95% CI 0,422-0,976, p=0,045). In the group of women, the GG rs17797829 genotype is protective for SCD (OR=0,392, 95% CI 0,203-0,760, p=0,007), in the group of women over 50, except for the GG genotype, the AA genotype of the same polymorphism is associated (OR=2,739, 95% CI 2,176-3,448, p=0,020).

Conclusion

Conclusion. According to the results of study, single nucleotide polymorphisms rs6582147 rs10010305, rs2136810, rs17797829 confirmed the association with SCD.

внезапная сердечная смертьGWASrs6582147rs10010305rs2136810rs17797829sudden cardiac deathGWASrs6582147rs10010305rs2136810rs17797829Президент Российской Федерации; Ю.П. НикитинRF President; Yuri P. NikitinReferencesPriori SG, Aliot E, Blomstrom-Lundqvist C, et al. The Task Force for the Management of Patients with Ventricular Arrhythmias and the Prevention of Sudden Cardiac Death of the European Society of Cardiology (ESC). Europace. 2015;17(11):1601-87 Doi:10.1093/europace/euv319.Priori SG, Aliot E, Blomstrom-Lundqvist C, et al. The Task Force for the Management of Patients with Ventricular Arrhythmias and the Prevention of Sudden Cardiac Death of the European Society of Cardiology (ESC). Europace. 2015;17(11):1601-87 Doi:10.1093/europace/euv319.Garcia-Elias A, Benito B. Ion Channel Disorders and Sudden Cardiac Death. Int J Mol Sci. 2018;19(3). Pii:E692. Doi:10.3390/ijms19030692.Garcia-Elias A, Benito B. Ion Channel Disorders and Sudden Cardiac Death. Int J Mol Sci. 2018;19(3). Pii:E692. Doi:10.3390/ijms19030692.White JL, Chang AM, Cesar S, et al. Can sudden cardiac death in the young be predicted and prevented? Lessons from autopsy for the emergency physician. Emergencias. 2018;30(3):194-200.White JL, Chang AM, Cesar S, et al. Can sudden cardiac death in the young be predicted and prevented? Lessons from autopsy for the emergency physician. Emergencias. 2018;30(3):194-200.Razuin R, Nurquin F, Shahidan MN, et al. Sudden cardiac death with triple pathologies: A case report. Egypt Heart J. 2017;69(2):157-60. Doi:10.1016/j.ehj.2017.02.001.Razuin R, Nurquin F, Shahidan MN, et al. Sudden cardiac death with triple pathologies: A case report. Egypt Heart J. 2017;69(2):157-60. Doi:10.1016/j.ehj.2017.02.001.Бабенко В.Н., Максимов В.Н., Кулакова Е.В. и др. Полногеномный анализ пулированных выборок ДНК когорт человека. Вавиловский журнал генетики и селекции. 2014;18(4-2):847-55.Babenko VN, Maksimov VN, Kulakova EV, et al. Genome-wide snp allelotyping of human cohorts by pooled DNA samples. Vavilovskij zhurnal genetiki I selekcii. 2014;18(4-2):847- 55. (In Russ.).Sambrook J, Russell DW. Purification of nucleic acids by extraction with phenol:chloroform. CSH Protoc. 2006;2006(1). Pii:pdb.prot4455. doi:10.1101/pdb.prot4455.Sambrook J, Russell DW. Purification of nucleic acids by extraction with phenol:chloroform. CSH Protoc. 2006;2006(1). Pii:pdb.prot4455. doi:10.1101/pdb.prot4455.Marki S, Goblos A, Szlavicz E, et al. The rs13388259 Intergenic Polymorphism in the Genomic Context of the BCYRN1 Gene Is Associated with Parkinson's Disease in the Hungarian Population. Parkinsons Dis. 2018;2018:9351598. Doi:10.1155/2018/9351598. eCollection 2018. Doi:10.1155/2018/9351598.Marki S, Goblos A, Szlavicz E, et al. The rs13388259 Intergenic Polymorphism in the Genomic Context of the BCYRN1 Gene Is Associated with Parkinson's Disease in the Hungarian Population. Parkinsons Dis. 2018;2018:9351598. Doi:10.1155/2018/9351598. eCollection 2018. Doi:10.1155/2018/9351598.Chaudhari A, Haversen L, Mobini R, et al. ARAP2 promotes GLUT1-mediated basal glucose uptake through regulation of sphingolipid metabolism. Biochim Biophys Acta. 2016;1861(11):1643-51. Doi:10.1016/j.bbalip.2016.07.009.Chaudhari A, Haversen L, Mobini R, et al. ARAP2 promotes GLUT1-mediated basal glucose uptake through regulation of sphingolipid metabolism. Biochim Biophys Acta. 2016;1861(11):1643-51. Doi:10.1016/j.bbalip.2016.07.009.Шляхто Е.В., Арутюнов Г.П., Беленков Ю.Н. и др. Национальные Рекомендации по определению риска и профилактике внезапной сердечной смерти. Архивъ внутренней медицины. 2013;(4):5-15.Shljahto EV, Arutjunov GP, Belenkov JuN, et al. Recommendations for risk assessment and prevention of sudden cardiac death Archive of internal medicine. 2013;(4):5-15. (In Russ.).

The authors declare that there are no conflicts of interest present.